[Soutenance de thèse] 24/06/2025 – Cloé JOLY : « Écologie, éthologie et dynamique parasitaire en pâturages : le zèbre, ses parasites gastro-intestinaux et les coléoptères coprophages » (UPR 406 – AE – Abeilles et Environnement)

Madame Cloe JOLY soutiendra publiquement ses travaux de thèse intitulés : « Écologie, éthologie et dynamique parasitaire en pâturages : le zèbre, ses parasites gastro-intestinaux et les coléoptères coprophages » le mardi 24 juin 2025 à 13h00.

Laboratoire

UPR 406 – AE – Abeilles et Environnement

Composition du jury de soutenance

Mme Freddie-Jeanne RICHARD	Avignon Université	Directrice de thèse
Mme Marion VITTECOQ	Institut de recherche pour la conservation des zones humides méditerranéennes La Tour du Valat	Rapporteure
M. Mickael HEDDE	INRAE, UMR Eco & Sols	Rapporteur
Mme Julie BRUNET	Institut de parasitologie et de pathologie tropicale Strasbourg (IPPTS)	Examinatrice
M. Thierry DUTOIT	IMBE – UMR CNRS 7263	Examinateur
M. Pierre JAY-ROBERT	Université de Montpellier Paul-Valéry	Co-directeur de thèse
Mme Alix ORTEGA	La Réserve Africaine de Sigean	Co-directrice de thèse
M. Antoine JORIS	La Réserve Africaine de Sigean	Invité

Résumé

Les années 1970 marquent le début de la commercialisation des principales molécules antiparasitaires. Depuis, les animaux d’élevage sont régulièrement et systématiquement traités, souvent en surdosage. Ces pratiques ont mené à l’apparition de parasites résistants aux antiparasitaires, et à une pollution environnementale importante. Plusieurs études rapportent un impact négatif de cette pollution sur la plupart des arthropodes du sol, dont certains ont un rôle majeur dans le contrôle des parasites d’herbivores présents dans les déjections. Les travaux de recherche présentés dans ce manuscrit s’intègrent dans le contexte des parcs zoologiques, dont les activités de divertissement sont aujourd’hui complétées par les missions d’éducation, de bien-être animal, de recherche et de conservation. Nous nous sommes intéressés à l’écologie des pâturages dans des enclos multi-espèces d’herbivores, à travers trois modèles biologiques concernés par l’utilisation d’antiparasitaires : les équidés, leurs parasites gastro-intestinaux et les coléoptères coprophages. Les travaux présentés se sont déroulés selon deux axes principaux d’investigation. Au cours du premier axe, nous avons examiné la relation hôte-parasites chez les Zèbres de Grant (Equus quagga boehmi). Les trois études présentées utilisent des suivis parasitaires et comportementaux individuels, afin d’améliorer les méthodes de vermifugation raisonnée existantes. Nous nous sommes ainsi intéressés aux prédicteurs de la variation d’excrétion fécale des œufs de strongles, avec ou sans administration d’antiparasitaires. Au cours de cette première partie de thèse, nous avons montré que les comportements sociaux sont déterminants de la vitesse de ré-excrétion après un traitement antiparasitaire. De plus, nous avons mis en évidence l’importance des conditions climatiques, quelque soit l’âge, et l’importance des périodes de bouleversements sociaux chez les jeunes, pour expliquer les variations d’excrétion fécale des œufs de strongles au cours du temps. Au cours du deuxième axe, nous avons examiné comment les diversités d’habitats impactent les communautés de coléoptères coprophages. Parmi les trois études présentées, deux s’appuient sur des méthodes de piégeage in situ et une s’appuie sur des expérimentations en laboratoire incluant l’élevage de l’espèce Onthophagus vacca et la réalisation de tests comportementaux et physiologiques sur cette même espèce. L’objectif de ce second axe était de mettre en évidence le lien entre pratiques de gestion des enclos d’herbivores et communautés de coléoptères coprophages afin de permettre aux directions des zoos de mieux intégrer les problématiques de conservation de la faune sauvage locale. Au cours de cette seconde partie de thèse nous avons montré que la diversité des herbivores ne semble pas être un facteur de diversité au sein des communautés de coprophages, bien que les herbivores aient accès à la même ressource alimentaire. Nous avons aussi mis en évidence l’importance de l’intensité de l’utilisation du sol sur l’abondance et la diversité de ces communautés. Enfin, dans une dernière étude nous avons abordé la plasticité de l’espèce O. vacca et les mécanismes d’évolution locaux.

Mots-clés : comportement sociaux, Zèbres, Bousiers, relations trophiques, relation hôte parasite, pâturages